Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQGAP1P46940 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms