Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms