Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms