Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGEA3P43357 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms