Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBX2P40425 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBX2P40425 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms