Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD12P35452 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms