Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C19P33261 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C19P33261 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms