Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA5P30532 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms