Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTGFP29279 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTGFP29279 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTGFP29279 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTGFP29279 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTGFP29279 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTGFP29279 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTGFP29279 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTGFP29279 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTGFP29279 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTGFP29279 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTGFP29279 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTGFP29279 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTGFP29279 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTGFP29279 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms