Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms