Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKACBP22694 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKACBP22694 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms