Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms