Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR1P18146 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EGR1P18146 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms