Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAP43P17677 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAP43P17677 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 383.6 ms