Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A1P13866 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms