Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms