Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms