Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN1P12814 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms