Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP3P12645 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP3P12645 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP3P12645 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP3P12645 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BMP3P12645 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BMP3P12645 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BMP3P12645 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP3P12645 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms