Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms