Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms