Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYF2O95926 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYF2O95926 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYF2O95926 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYF2O95926 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYF2O95926 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms