Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms