Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PRSS8-203ENST00000567531 729 ntTSL 318.89■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 144.8
SF3B1O75533 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 144.8
SF3B1O75533 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 144.8
SF3B1O75533 ARHGAP22-207ENST00000460425 2764 ntTSL 217.26■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 144.8
SF3B1O75533 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 144.8
SF3B1O75533 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 144.8
SF3B1O75533 PRSS8-202ENST00000564025 521 ntTSL 213.44□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 144.8
SF3B1O75533 PRSS8-204ENST00000567797 552 ntTSL 412.21□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 144.8
SF3B1O75533 PTPRA-208ENST00000455631 1107 ntTSL 525.86■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-212ENST00000560370 620 ntTSL 317.28■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-203ENST00000558273 1502 ntTSL 217.18■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-202ENST00000471700 706 ntTSL 315.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-204ENST00000558931 2754 ntTSL 514.62□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-209ENST00000559453 1721 ntTSL 510.58□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 RABGAP1-202ENST00000373647 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 PSME2-207ENST00000559056 512 ntTSL 58.89□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 RABGAP1-205ENST00000456584 3897 ntTSL 24.64□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 ABHD16A-214ENST00000495769 1892 ntTSL 521.62■■□□□ 1.051e-10■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 ABHD16A-208ENST00000477016 868 ntTSL 517.48■□□□□ 0.391e-10■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 ABHD16A-207ENST00000475742 1319 ntTSL 516.85■□□□□ 0.291e-10■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-10■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-10■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 ABHD16A-212ENST00000492084 2260 ntTSL 214.26□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 ABHD16A-205ENST00000471644 746 ntTSL 311.99□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 144.7
SF3B1O75533 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)8.02□□□□□ -1.134e-6■■■■■ 144.6
SF3B1O75533 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 144.6
SF3B1O75533 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 144.6
SF3B1O75533 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 215.25■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 144.5
SF3B1O75533 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 144.4
SF3B1O75533 MBD5-208ENST00000478804 592 ntTSL 52.7□□□□□ -1.982e-7■■■■■ 144.4
SF3B1O75533 MBD5-218ENST00000636620 475 ntTSL 51.18□□□□□ -2.222e-7■■■■■ 144.4
SF3B1O75533 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 144.3
SF3B1O75533 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 144.3
SF3B1O75533 HM13-203ENST00000344042 847 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 144.3
SF3B1O75533 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 144.3
SF3B1O75533 CAPN2-203ENST00000434648 577 ntTSL 513.48□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 144.3
SF3B1O75533 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 144.1
SF3B1O75533 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 144.1
SF3B1O75533 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 144
SF3B1O75533 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 144
SF3B1O75533 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A13-210ENST00000531419 785 ntTSL 523.51■■□□□ 1.351e-8■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A13-211ENST00000531865 846 ntTSL 519.86■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A13-209ENST00000529740 558 ntTSL 219.69■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A13-205ENST00000526614 827 ntTSL 519.65■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.341e-8■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 144
SF3B1O75533 AC108062.1-202ENST00000509834 743 ntTSL 516.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 144
SF3B1O75533 AC108062.1-204ENST00000504984 742 ntTSL 213.65□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 144
SF3B1O75533 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 144
SF3B1O75533 AC108062.1-203ENST00000511497 2012 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 144
SF3B1O75533 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 144
SF3B1O75533 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 144
SF3B1O75533 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 144
SF3B1O75533 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.954e-6■■■■■ 143.9
SF3B1O75533 SLC39A11-209ENST00000580557 794 ntTSL 315.43■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 143.9
SF3B1O75533 SLC39A11-214ENST00000583146 532 ntTSL 510.19□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 143.9
SF3B1O75533 TCF3-216ENST00000592395 996 ntTSL 520.26■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 143.8
SF3B1O75533 TCF3-211ENST00000587425 629 ntTSL 216.82■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 143.8
SF3B1O75533 TCF3-217ENST00000592628 1751 ntTSL 516.53■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 143.8
SF3B1O75533 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 143.8
SF3B1O75533 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 143.7
SF3B1O75533 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 327.47■■□□□ 1.991e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 NPL-207ENST00000460690 804 ntTSL 322.43■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 521.23■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-214ENST00000595722 1826 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 NPL-211ENST00000488424 2144 ntTSL 1 (best)20.96■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-206ENST00000558501 873 ntTSL 519.56■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-211ENST00000560412 568 ntTSL 418.71■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 IMPDH1-216ENST00000497868 952 ntTSL 518.36■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 HDAC4-213ENST00000496347 995 ntTSL 317.29■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 CERS4-212ENST00000561008 531 ntTSL 416.94■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 IMPDH1-212ENST00000489263 598 ntTSL 316.65■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 STRN4-210ENST00000594847 814 ntTSL 316.43■□□□□ 0.225e-14■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 VMP1-206ENST00000587945 583 ntTSL 315.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 NPL-208ENST00000463899 2369 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 STRN4-213ENST00000596016 556 ntTSL 414.68□□□□□ -0.065e-14■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 VMP1-210ENST00000589823 580 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 143.6
SF3B1O75533 VMP1-203ENST00000586245 544 ntTSL 414.66□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 143.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1081 ms