Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG13O75143 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG13O75143 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG13O75143 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG13O75143 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG13O75143 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG13O75143 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG13O75143 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG13O75143 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG13O75143 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG13O75143 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG13O75143 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG13O75143 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG13O75143 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms