Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSCO60682 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSCO60682 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSCO60682 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSCO60682 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSCO60682 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms