Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD5O60279 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms