Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms