Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRC1O43663 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRC1O43663 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms