Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI2O43237 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms