Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms