Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H3BQ06 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H3BQ06 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H3BQ06 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H3BQ06 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H3BQ06 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H3BQ06 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H3BQ06 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H3BQ06 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H3BQ06 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H3BQ06 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H3BQ06 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H3BQ06 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H3BQ06 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H3BQ06 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H3BQ06 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H3BQ06 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms