Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB9F8W1W9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms