Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCRIP1C9JLW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms