Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM1B2RUZ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms