Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms