Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJR5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJR5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJR5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJR5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJR5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJR5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJR5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJR5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJR5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJR5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJR5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJR5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJR5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NJR5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NJR5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NJR5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NJR5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NJR5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NJR5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms