Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms