Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms