Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA3Q9Y6H8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms