Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms