Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms