Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRELID3BQ9Y3B1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms