Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms