Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms