Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms