Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms