Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN3Q9P232 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms