Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL20A1Q9P218 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms