Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms